【IT】スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別

1 :田杉山脈 ★:2020/07/06(月) 21:50:34 ID:CAP_USER.net
理化学研究所(理研)は、スーパーコンピュータ「富岳」を活用し、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となりうる数十種類の物質を発見したと発表した。7月3日、オンラインで開催した「新型コロナウイルスの治療薬候補同定」の中間報告のなかで、理化学研究所 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログム副プログラムディレクターであり、京都大学大学院医学研究科教授の奥野恭史氏が明らかにした。

 奥野教授は、「1つの標的タンパク質に対するすべての薬剤での評価が終了し、興味深い結果が出た。残り3つの標的タンパク質においても同様の評価をしたい」とする一方、「数千規模の化合物とタンパク質の作用(結合)過程を、分子動力学計算レベルで計算した事例は世界でもはじめてであり、学術的にインパクトがある」と発言。

 さらに、「今回の結合シミュレーションには約10日間を要したが、ソフトウェアのチューニングが富岳用にできていないかたちで実施したものである。チューニングができれば、将来的には2日程度で計算が完了すると考えている。1週間あれば、1万以上の薬剤が評価できるようになり、創薬の世界を大きく変えることができる」と述べた。
以下ソース
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1263445.html

3 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 21:51:23 ID:cpKvbWaA.net
俺にも使わせてくれ
ソシャゲが快適にプレイできるか試したい
8 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:03:12.11 ID:7IYd1u14.net
>>3
意外と出来ないと思うぞ
42 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:25:32 ID:4mMaDjNE.net
>>3
富岳の計算能力は大体スマホ3000万台分
4 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 21:55:07.61 ID:/0qWIPOR.net
さすがARMの高性能CPUはすごいな
6 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:00:31.25 ID:nFc+VITg.net
今は分子動力学計算でそんなことまで解るようになったんだな
9 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:04:54.71 ID:jORb0OlU.net
分子動力学計算はgrapeの方が計算速いはずだけど、ARMベースのほうがプログラム構築が汎用的で使いやすいのかな。
56 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:42:37.41 ID:KqiHOmUJ.net
>>9
grapeは専用命令を追加したプロセッサだったような。ただ並列度はわからん。
以前にEDAベンダーのセミナーで発表があった。いわゆる「当社のツールを使ってプロセッサを開発しました」っていう内容で。
もっとも、スパコンとなると並列度が全然違うからな。
10 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:05:03.51 ID:Q5OMRiJV.net
登山漫画の最高峰
22 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:10:16.79 ID:FCdKzH+l.net
>>10
中島の新型超重爆撃機だぞ

朝鮮人w

12 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:06:37.45 ID:1g63xeLY.net
富嶽もARM系だってな!
14 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:07:30.90 ID:SB6CTMjf.net
おれが死ぬ確率と死ぬXデーの予測してくれ
52 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:36:02 ID:85CYw3+B.net
>>14
ワイコンピュータの計算によると2120年7月1日の時点で生存確率0.001%や
77 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 23:08:11.32 ID:xBFF/Y6s.net
>>14
早よ成仏せーよ
南無南無
15 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:08:04.15 ID:xWGlDrgE.net
富嶽で使われるARMは、AmazonのAWSにも使われているよ。
16 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:08:50.12 ID:svClXDTx.net
でも明日の天気すら当たらないんだろ。
アホみたいに被害も出てるし何の役にも立たない。
17 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:09:09.59 ID:t7vAEC5j.net
臨床試験もバーチャルでできないの?
18 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:09:14.35 ID:IAsaYLDT.net
新薬ができるのは早くて2,3年だろうね。
順調に行けば5年ってとこ
それまでは代用品でだな
19 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:09:18.75 ID:4gbHHukk.net
税金で飯食ってる世界中の二重国籍者の分析をお願いいたします
20 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:09:20.11 ID:1E8UAD1S.net
で、実際の医療現場で薬使えるようになるのはいつなんだい?
27 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:13:25.25 ID:dbhLOVRn.net
 

2000も出せば何個かあたって当たり前。

 

28 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:13:31.54 ID:v377R+CF.net
ガスター10で、乗り切るから余裕
30 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:14:39.23 ID:hzuHVl89.net
ハゲ治療薬がやっと完成する?
31 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:14:44.29 ID:in4rXIyi.net
いや1種類を選別するならまだしも2000種ってどでもいいだろ
34 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:17:40.20 ID:EnnTwFM9.net
1種類でも年単位で試験するのに2000種類も試験してたら
いつ出来るのやら。

2位のスパコンで良いんじゃね?

36 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:19:44 ID:9i/mAyrD.net
公務員大量解雇時代到来消費税なくなるぞ
45 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:30:02 ID:F6x0oXEo.net
仮想化して分散処理させた計算とどう違うの?
46 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:30:19 ID:ncbxTIVS.net
他国のスパコンだってその位やってるだろう

ぶっちぎりの1位でもないのに

48 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:32:28 ID:4mMaDjNE.net
>>46
今はぶっちぎりの一位
そして4種類のベンチマーク全てでの一位(4冠)は史上初
49 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:32:31 ID:N8Jd+OdJ.net
富岳チューニングするための丁度良いデータ取りになるからこいつじゃないと意味ないだろうし
ガンガン使って使い勝手上げてほしいものだね
55 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:42:12.05 ID:iQIrvROd.net
どえらい投資をしてるんだから
 「ワクチンの100や200位」見つけ出すだろう 
   一日も早く先んじて元を取り返すんだな!
62 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:49:56.77 ID:Rc/uT9E1.net
所詮はまだ机上の理論状態
64 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:50:52.72 ID:O2MKxlNA.net
俺もすごい連立方程式考える仕事したいレス
66 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:52:24.02 ID:r9+aynDz.net
2000ってふざけて居るのか、
2個とは言わないが、せめて20個に絞り込めよ
70 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 22:57:20.40 ID:OmpjzYeZ.net
あくまでシュミレーション上の結果だから良さそうなシャブを実際に使っても全然クソってのもありうる
全部治験してからの話でしかない
そんなんしてる間に変異するから厄介だしな
72 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 23:00:07.52 ID:z2XuF2+g.net
ホンダF1制覇の日々
充実してたなあ
JAXAのはやぶさ2と富岳とで
戻ってくりゅ?
74 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 23:04:22.83 ID:kkRSdIun.net
富岳10台くらいすぐ作れ
75 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 23:05:23.04 ID:h8nKQGyE.net
しかしスパコンの性能が凄くなっても世の中良くならないもんだな。
79 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 23:11:24.90 ID:A2091wxe.net
富岳スゴイ
85 :名刺は切らしておりまして:2020/07/06(月) 23:17:49 ID:wR2xIpx9.net
リケンのわかめ

引用元:http://anago.2ch.sc/test/read.cgi/bizplus/1594039834